L’histoire se déroule dans un monde où des individus appelés « Ajin » existent. Les Ajin sont des êtres humains immortels qui ont la capacité de régénérer instantanément leur corps, même après la mort. Cette particularité suscite la crainte et la discrimination de la part de la société.
L’intrigue suit Kei Nagai, un lycéen ordinaire qui découvre qu’il est un Ajin après avoir été renversé par un camion. Cherchant à échapper aux autorités qui souhaitent le capturer pour des expériences, Kei se retrouve dans une lutte pour sa survie. Il est aidé par un autre Ajin, Kaito, et ils se lancent dans une quête pour comprendre les origines de leur condition et les mystères entourant les Ajin
